高校部门工会的基本职能有四项，一是维护职能，即维护教职工的合法权益；二是建设职能，即动员教职工参加建设和改革；三是参与职能，即组织教职工参与民主管理；四是教育职能，帮助教职工提高思想文化素质。
一、维护职能。在学院党组织的领导下，积极维护教职工的合法权益。定期召开教代会，学院内涉及重大教职工权益的有关工作或福利政策，须经教代会通过。日常注意听取和收集教职工的意见，涉及教职工权益的，要与有关部门沟通并及时给教职工以答复。部门工会主席应代表教职工的利益，积极参加学院院务委员会会议，站在教职工的立场发表意见，参与决策。
二、建设职能和参与职能。积极动员教职工参加学院各项建设，在教学、科研和学院文化建设方面做一些工作。每学期协助学院召开两次教学和学生工作沙龙，发动教职工对教学和学生工作方面进行反思，找出薄弱环节和问题，提出建议。在学期开始阶段开一次，提出问题和建议；在学期结束时再开一次，进行总结。组织一次学院的校友返校活动，建立一个校友的交流平台，听取校友对学院教学和学生工作的意见。协助学院组织青年教工学术沙龙，每月一次邀请有关专家参加，启发青年教工的学术思维，活跃学院的学术气氛，促进学院的科研工作；
三、教育和桥梁纽带作用。协助学院党总支组织学院教工的学习活动，邀请有关专家为教职工提供有益的讲座，积极开展文化活动，提高学院教职工的总体素质。发挥纽带作用，有两个方面，一是作教工和学院之间的纽带；一是作教工之间的纽带；排除相互间的误解，避免磨擦，增加沟通和理解。为此，部门工会应在平时注意发现问题，及时沟通解决问题，此外还要组织学院教工集体的文化娱乐活动，创造交流机会、建立沟通的平台。每学期至少要安排两次活动，一是在学期开始时，举办一次聚餐会，一是在元旦时组织学院的“忘年会”集体迎接新年。此外，积极组织学院体育健身活动，进行乒乓球比赛；组织排球训练营，邀请排球教练指导，组织排球运动和比赛；组织游泳训练营，每周五，邀请游泳好的教工指导有游泳爱好的教职工，使他们学会游泳、提高游泳技能。
四、教职工福利和送温暖活动。根据年节和季节，协助学院发放相关的福利物品和奖金。在春秋两季组织教职工的疗休养活动。对生病或生育的教职工要积极地关心，进行探望和慰问。对生活困难的教职工要给予力所能及的帮助，并协助向校工会申请补助。