肖晓是个调皮、爱探索的五年级小学生，他学习不好纪律也很差，是班中班外“美名”远扬的“知名人士”，令老师们都很头疼。还不都是因为他总是和他那几个好哥们——卓远轩、刘盛里、李兴原每时每刻都在玩，整天想念些稀里古怪的东西，听不进课。
一个晚上，已经是深夜了。肖晓好不容易做完了作业，赶快爬上床去睡觉，不一会儿就呼呼入睡了。在梦里，他梦到一个怪家伙。近看，原来是个发着蓝光的星星。蓝星星地说：“我是个神奇的星星，我能告诉你一个好玩的地方。它就是你们学校的地下室，里面有好东西。”没等肖晓插一句话，它就消失了。
第二天一早，他就醒来了。“怪了，昨天梦里的事我还记得呢！而且，学校的确有个地下室呀？蓝星星怎么会知道呢？难道它说的是真的？恩，不管怎么样，跟卓远轩他们说一下吧！”他想着，连早餐也没吃，就急着出门，把这一大消息告诉了他们。
“哎？太好了！我们去地下室吧！”另三个迫不及待地说。“你们这么相信？” 肖晓问。“去一下怕什么？没有东西去一趟又不会怎么样，去了还知道有没有呢？” 另三个嫌肖晓拖拖拉拉。“好吧。”他们决定在体育课上偷跑去看。
地下室原来是学校的秘密室，也不知里面是干什么的，现在成了仓库，也有些老师经常路过，被看到进去是要被抓去受罚的。所以，肖晓他们不知看了多少次是否有老师经过才悄悄地走进去。地下室很黑。肖晓拿着手电筒照明，四个人小心翼翼地走下阶梯，生怕弄出一点声音。地下室很乱，蜘蛛网结了一大片，灰尘无处不钻，室里的一个旧书架上挂着个破钟，墙上到处贴满了图画，角落有盏破了的灯，一个木箱里放着许多破破烂烂的书……好像好久没有整理过。“好象第二次世界大战。” 肖晓小声说。“好乱啊…快找有什么好宝贝？” 李兴原早已按捺不住。“找啊！要不呆会儿下课了！” 卓远轩皱着眉头说。“恩！小心不要弄出声音啊！” 刘盛里说。大家在混乱堆中翻了好久，全是破烂，无一好东西！
“真可恶！什么都没有！害我们白挖了。”大家埋怨着，肖晓却还在拼命地挖。“走吧！肖晓。”正当大家要走时，肖晓突然很高兴地小声说：“我找到个好东西啦！” 大家一听，赶忙跑过去看。只见肖晓满手脏脏的，裤子有些地方都刮烂了，两手小心地捧着一个发着荧绿色的光的蛋。“哇！帅！这是什么？哪有这样的怪蛋呀？”大家被这个怪蛋吊起了极大的探究胃口。“我要好好研究研究！” 肖晓不禁惊喜得连声音都颤抖了。“我们也来！”四人挖了那么久，终于有收获了！但这么宝贵的蛋会发光，很容易被人家发现的！到时候不见了怎么办？！于是，四人就又悄悄地跑回教室。此时还没下课，教室里空无一人，四人商量好后，一致让肖晓在抽屉里做个“睡袋”——用厚厚的校服外套把怪蛋包了一层又一层，然后把小“睡袋”放在抽屉角落里，再盖上几本书，就大公告成了！他们四个一击掌，说好下午在学校的操场上看怪蛋。
下午，操场上空空如也。“下午终于到啦！” 肖晓激动地说。“怪蛋呢？”另三个问道。肖晓迫不及待地把怪蛋从校服外套里轻轻拿出。怪蛋仍发着绿色的荧光。卓远轩仔细端详了怪蛋一番，手托下巴，故作严肃，说：“这会不会是——”“是什么啊？”“恩，我在报纸上看过一篇，说韩国研究机构在鸡的体内植入水母的蛋白，鸡在紫外线的照射下就会发出明亮的绿色荧光哩！”“拜托，那是在鸡的体内哎！不是蛋的体内啊！” 刘盛里说。“可没说啊！” 卓远轩抗议说。“可也没说鸡蛋里能植入啊！” 刘盛里向卓远轩做了个鬼脸。“好了好了，别吵了。不管怎么说，这蛋肯定有古怪！” 肖晓坚定地说。“咦？不如我们孵蛋？反正都是蛋！” 李兴原笑嘻嘻地说。原本李兴原只是开玩笑，没想到肖晓当真了！“恩，好主意！” 肖晓点着头，自言自语地说。“你还当真啊？？！” 李兴原瞪圆了眼。卓远轩和刘盛里也大吃一惊。“恩，我回家孵，当然，我会天天带到学校来照顾怪蛋的。”肖晓又把怪蛋包了起来。“回家吧。哦，对了，怪蛋这个秘密要保守起来哦！” 肖晓背好书包走了。“恩？”三人互相对视。“他疯啦？”
第二天。
“早上好！嘿嘿！” 肖晓今天显得特别高兴，一个劲的问好。“兄弟，你吃错药了吗？” 李兴原把手在肖晓眼前摆来摆去。“你懂不懂啊你，人家有好事啦！对不对？”刘盛里向李兴原甩甩手。“恩，还是刘盛里，哦不，应该是刘老兄聪明，啊？”肖晓放下书包。“什么事啊？那么——”另三人急忙问。“嘿嘿！我老兄昨晚孵了一整晚的蛋哩！你猜怎么着？”肖晓拍拍胸脯，自豪地说。“怎么啦？孵出来啦？”“不，蛋上有裂纹了！我估计今天就能孵出来！” 肖晓兴奋得不得了。“哇，那你带来了吗？”三人急着要看。“当然了，不过现在有人。” 肖晓做了个“嘘”的动作。“哦，那好。”
数学课上——
“今天我们来学习代数。” 数学高老师一手拿着厚厚的教学课本，一手拿着粉笔转身在黑板上写标题。课堂上一片嘈杂声，有的同学在说话，有的同学在看小说，有的同学在玩游戏……肖晓则在看他的宝贝。数学老师趁同学们不注意时迅速转过身，大家措手不及，一下被点了好几人的名，各个害怕不已，也停止了喧哗。数学老师有点老，他有个秃头，戴着高度近视的眼镜，整天板着张臭脸。大家都端坐好了，只有肖晓还在全神贯注地看着他的蛋呢！高老师见肖晓居然没反应，很生气，走到他跟前。“你在玩什么？？！！”高老师皱眉瞪眼地问。“没，没，没什么。”肖晓被吓得说话都结巴了。“不可能！给我拿出来！”高老师把手往肖晓的抽屉里一伸，拿出了个蛋。他并不惊奇这蛋是荧绿色的，认为这是个玩具。大家却各个往蛋那里看。“哇哦！！会发光的蛋！我看看~”“我要看！”各个一窝蜂地拥向高老师。“挤什么挤，这是我的！走开！”肖晓很生气，伸手要去拿怪蛋。高老师拿着蛋，不小心被同学们撞了个趔趄，蛋掉到了地上。大家都惊呆了，霎时全安静下来，并停止了拥挤。肖晓也吓坏了，好久才反应过来，不禁哭了起来。“呜呜~我的蛋啊~” 高老师一改平时严肃的脸，笑着安慰肖晓：“别哭了，是老师不好，打破了你的蛋。你再买个就行啦，老师付钱。”高老师到现在还以为这是个玩具。肖晓听了，哭笑不得，说：“老师，这，这不是玩具呀！这是——” 肖晓便把他们去挖怪蛋的过程讲了一遍。高老师惊得连连点头，同学们也不时发出“哇哇——”的叫声。“是这样啊，那怎么办？”突然，裂开的怪蛋里飘出一股青烟，慢慢成了一只手掌大的小恐龙。恐龙越变越大，渐渐长到课室的天花板了，眼看就要撑破屋顶了，肖晓不禁大叫：“别再变大啦！！”奇了，那恐龙听了后就不再变大了，而是变小了，成了两只手那么小的恐龙了。
肖晓拍了拍惊吓的胸脯，好久才回过神。恐龙友好地向肖晓敬了个礼：“你好，主人，我叫神奇龙，我具有神奇的力量。” 肖晓又吓了一跳：恐龙会说话？！肖晓低头一看，这才看清恐龙的真面目：青绿色的身子，长长的尖尖的尾巴，眼睛是又蓝又圆的，嘴巴里有锋利的牙齿。跟以前的恐龙没什么两样。
“你为什么叫我主人？还有，你为什么要变大去顶破天花板？”肖晓指了指天花板，生气地问。“是你孵出了我，所以你是我主人嘛。至于顶破天花板，是因为刚刚哪个坏蛋把我摔在地上？好痛啊！所以我要报复一下。” 恐龙说着，用深蓝的眼睛向周围扫视。同学们看着恐龙，都惊讶得什么话也说不出了。
“好了好了，别看了。先想想你怎么办？我们家里都不能养你，但学校又不能养动物，何况是恐龙？不把校长吓死和气死？？！”肖晓说。“不怕，只要我对学校有巨大贡献，校长会收留我的。”恐龙说。“那我们带神奇龙去校长室吧！跟校长说说。” 高老师也支持肖晓。“好！”同学们都拥向校长室。
到了校长室里——
“什么？你们搞什么鬼？？！！想吓死人啊？不可以留恐龙下来！”校长坚定地说。“如果我能为你们学校做贡献呢？” 恐龙问。“哈哈~笑死人啦！一只笨恐龙能做什么？还不是糟蹋东西？” 校长笑个不停。“你，你可不要小看我！我能帮你们建楼、搬重物……别忘了，我能变大缩小的！而且，我是只与众不同恐龙哦！你不试用我怎么知道我会干什么呢？” 恐龙气得脸都红了。“恩？真的吗？” 校长听了恐龙的自我推荐问。“保证一切让您满意！” 肖晓和高老师都齐声说。校长看看同学们期盼的目光和恐龙自信的保证，犹虑了一下，最终还是答应了。“耶！——”大家欢呼起来。
第二天，校长在国旗下讲话时特地把恐龙介绍了一番给全校师生和学校外的家长：“这是我们学校的新成员——神奇龙！它……”
以后，恐龙便在学校住下了，学校特准让它在肖晓那个班住。每次下课，肖晓那个班的教室前便“人山人海”——全都来看神奇龙的。大家经常跟神奇龙玩，久而久之，就没有人怕神奇龙了。它经常帮学校干活，跟同学们玩……所有人都喜欢它。当校长退位后，继承人便是——神奇龙！